宣政院是元朝掌管全国佛教事宜和藏族地区军政事务的中央机关，由帝师兼领。忽必烈始置总制院，后改为宣政院。自此，西藏成为中央政府直接管辖的一个地方行政区域。

　　1264年，总制院设立，以国师八思巴领之。二十五年，尚书右丞相兼总制院使桑哥，以总制院统领吐蕃各宣慰司军民财谷，责任甚重，宜加崇异，奏请用唐朝皇帝在宣政院接见吐蕃使臣的典故，改名为宣政院，秩从一品，用三台银印。以帝师领院事。置院使二员（后增至十员），其为长者常以朝廷大臣担任，位居第二者由帝师推荐僧人担任。宣政院官属得自选用，与中书省、枢密院、御史台并为元朝四个独立的任官系统。灭宋以后，即置江南释教都总统；至元二十八年，又分设行宣政院于杭州，掌江南各省佛教，其后两度废而复置。吐蕃发生变乱，亦设行宣政院前往当地处置，唯重大军事行动需与枢密院商议。诸路、府、州、县置僧录司、僧正司、都纲司，为宣政院下属地方机构，管理各地佛寺、僧徒。同时扩大宣政院的规模，于院使下设同知、副使、参议、佥院等各二人。1311年，罢僧录等司，凡僧人词讼皆归管民官决断。1331年，复于各省置广教总管府十六所，掌僧尼政事，由宣政院选僧俗官任达鲁花赤、总管等职。

参考资料：白寿彝：《中国通史》，上海人民出版社，1999年。